La flota pesquera de Isla Cristina está compuesta por 258 embarcaciones, que se distribuyen en las siguientes modalidades:

• 150 barcos arrastreros que capturan fundamentalmente gambas, cigalas, langostinos, lenguados, pescadillas, acedías, besugos, etc.
• Los 12 barcos de cerco, dedicados principalmente a la captura de especies demersales como la sardina, boquerón y caballa.
• Las 50 embarcaciones dedicadas a la modalidad de la draga hidraúlica, que se dedican exclusivamente a la captura de la chirla. El sistema que utilizan estos barcos permite que el molusco llegue al mercado limpio de arena.
• Hay también 24 embarcaciones de rastro remolcado tradicional, dedicadas a la captura de marisco bivalbos: chirla, coquina, navajas, almeja...
• Finalmente hay 22 embarcaciones artesanales que se dedican a la captura de langostino, acedía, lenguado y pulpo.